La recherche thématique du PP Demain la Suisse est organisée en projets, qui sont eux-mêmes intégrés à des réseaux de recherche. La plupart de ces réseaux sont formés par des groupes de recherche interdisciplinaires, dépassant le cadre des instituts et des institutions. Ils s'articulent à partir d'un ancrage local ou d'un réseau suprarégional. Plusieurs de ces réseaux composent chaque module.